Séminaire
Je vous propose un point bibliographique sur les avancées les plus récentes dans le domaine de la recherche sur les archées du sol. Les analyses des métagénomes ont permis de suggérer qu’en termes de phylogénie, de nouvelles relations de parenté existent entre ces microorganismes et les eucaryotes, ce qui remet en perspective l’origine des eucaryotes. Un focus sera également fait sur l’étude des archées oxydatrices de l’ammonium (les AOA), pour examiner l’intérêt des approches de protéomique sur la reconstitution des voies métaboliques de l’azote chez ces microorganismes (on recherche l’équivalent archéen de l’hydroxylamine oxydase, qui catalyse le 2e étape de l’oxydation de l’ammonium en nitrite). Un autre focus sera également fait sur les mécanismes biochimiques proposés pour expliquer la présence d’AOA, et pas de bactéries oxydatrices de l’ammonium, dans les sols acides. Ces AOA acidophiles ne peuvent pas se développer à un pH supérieur à 6.
damien.jougnot@upmc.fr